Как преобразовать Блестящее приложение, состоящее из нескольких файлов, в легкодоступный и воспроизводимый пример Shiny?

Есть ресурсы о том, как создать минимальный, полный и проверенный пример в целом по переполнению стека и как сделать отличный R воспроизводимый пример. Тем не менее, нет никаких аналогичных рекомендаций для shiny вопросы, в то время как соблюдение определенных стандартов делает гораздо более вероятным предоставление качественных ответов, и, таким образом, ваш вопрос будет разрешен.

Однако задавать хороший блестящий вопрос может быть трудным. shiny приложения часто большие и сложные, используйте несколько источников данных, а код часто разделяется на несколько файлов, что затрудняет обмен легко воспроизводимым кодом с другими. Несмотря на то, что проблема может быть вызвана в server.R, этот пример не воспроизводится без содержимого ui.R (и, возможно, других файлов, таких как таблицы стилей или global.R). Копирование содержимого всех этих файлов по отдельности громоздко и требует от других пользователей воссоздать одну и ту же файловую структуру, чтобы иметь возможность воспроизвести проблему.

Итак, как преобразовать shiny приложение в хорошее воспроизводимый пример?

Ответы

Ответ 1

Пример данных

Конечно, все руководящие принципы, касающиеся выборочных данных, упомянутых в ответе на вопрос "как сделать отличный воспроизводимый пример R", также соблюдаются при создании вопросов, связанных с Shiny. Подводя итог: убедитесь, что для запуска кода не требуются дополнительные файлы. Используйте примеры наборов данных, таких как mtcars, или создайте несколько примеров данных с помощью data.frame(). Если ваши данные очень сложны и эта сложность действительно необходима для иллюстрации проблемы, вы также можете использовать dput(). Избегайте использования таких функций, как read.csv(), если, конечно, у вас нет вопросов, связанных с такими функциями, как fileInput.

Пример кода

Всегда уменьшайте ваш код до минимума, чтобы воспроизвести вашу ошибку или неожиданное поведение. Это включает в себя удаление вызовов на дополнительные файлы .CSS и .js и удаление ненужных функций в пользовательском ui и на server.

Блестящие приложения часто состоят из двух или трех файлов (ui.R, server.R и, возможно, global.R), например, это демонстрационное приложение. Тем не менее, желательно размещать ваш код в виде одного скрипта, чтобы другие могли легко его запустить, не создавая эти файлы вручную. Это легко сделать:

  • обертывание вашего интерфейса с помощью ui <- fluidPage(…),
  • сервер с server <- function(input,output, session) {…},
  • и впоследствии вызывая shinyApp(ui, server).

Итак, простой скелет для начала может выглядеть следующим образом:

library(shiny)

ui <- fluidPage(

  )

server <- function(input,output,session) {

}

shinyApp(ui, server)

Рабочий пример

Таким образом, принимая во внимание все вышесказанное, хороший пример Minimal, Complete и Verifiable для Shiny-приложения может выглядеть следующим образом:

library(shiny)

df <- data.frame(id = letters[1:10], value = seq(1,10))

ui <- fluidPage(
  sliderInput('nrow', 'Number of rows', min = 1, max = 10, value = 5),
  dataTableOutput('my_table')
  )

server <- function(input, output, session) {
  output$my_table <- renderDataTable({
    df[1:input$nrow,]
  })
}

shinyApp(ui, server)

Добавление CSS

Есть несколько способов добавить пользовательский CSS в приложение Shiny, как описано здесь. Предпочтительный способ добавить CSS в приложение Shiny в воспроизводимом примере - это добавить CSS в код, а не в отдельный файл. Это можно сделать, добавив строку в пользовательском ui приложения, например, следующим образом:

tags$head(tags$style(HTML('body {background-color: lightblue;}'))),