Ответ 1
Это внутренний механизм phpmyadmin для управления отношениями между таблицами.
Эта функция действительно полезна для таблиц MYISAM, которые не поддерживают внешние ключи и ограничения.
Определяя внутренние отношения в phpmyadmin, вы связываете таблицы вместе, которые иначе не могут быть связаны. Эта информация хранится в отдельной таблице phpmyadmin внутри вашего сервера MySQL (phpmyadmin.PMA_relation).
Однако это всего лишь внутреннее определение phpmyadmin и не влияет на сам mysql (не применяются ограничения внешнего ключа или ссылочная целостность).
Подробнее см. здесь.