R + построено: твердое тело вращения
У меня есть функция r(x)
, что я хочу вращаться вокруг x
оси, чтобы получить тело вращения, что я хотел бы добавить к существующему plot_ly
участка с использованием add_surface
(окрасили x
).
Вот пример:
library(dplyr)
library(plotly)
# radius depends on x
r <- function(x) x^2
# interval of interest
int <- c(1, 3)
# number of points along the x-axis
nx <- 20
# number of points along the rotation
ntheta <- 36
# set x points and get corresponding radii
coords <- data_frame(x = seq(int[1], int[2], length.out = nx), r = r(x))
# for each x: rotate r to get y and z coordinates
# edit: ensure 0 and pi are both amongst the angles used
coords %<>%
rowwise() %>%
do(data_frame(x = .$x, r = .$r,
theta = seq(0, pi, length.out = ntheta / 2 + 1) %>%
c(pi + .[-c(1, length(.))]))) %>%
ungroup %>%
mutate(y = r * cos(theta), z = r * sin(theta))
# plot points to make sure the coordinates define the desired shape
coords %>%
plot_ly(x = ~x, y = ~y, z = ~z, color = ~x) %>%
add_markers()
Как я могу сформировать фигуру, указанную выше, как поверхность plotly
(идеально открытую с обоих концов)?
Редактировать (1):
Вот моя лучшая попытка:
# get all x & y values used (sort to connect halves on the side)
xs <-
unique(coords$x) %>%
sort
ys <-
unique(coords$y) %>%
sort
# for each possible x/y pair: get z^2 value
coords <-
expand.grid(x = xs, y = ys) %>%
as_data_frame %>%
mutate(r = r(x), z2 = r^2 - y^2)
# format z coordinates above x/y plane as matrix where columns
# represent x and rows y
zs <- matrix(sqrt(coords$z2), ncol = length(xs), byrow = TRUE)
# format x coordiantes as matrix as above (for color gradient)
gradient <-
rep(xs, length(ys)) %>%
matrix(ncol = length(xs), byrow = TRUE)
# plot upper half of shape as surface
p <- plot_ly(x = xs, y = ys, z = zs, surfacecolor = gradient,
type = "surface", colorbar = list(title = 'x'))
# plot lower have of shape as second surface
p %>%
add_surface(z = -zs, showscale = FALSE)
Хотя это дает желаемую форму,
- Он имеет "зубы бритвы" близко к плоскости
x
/y
. -
Части половины не касаются. (разрешен путем включения 0
и pi
в theta
векторы) -
Я не понял, как покрасить его вместо x
вместо z
(хотя я пока не очень разбираюсь в этом). (разрешено gradient
матрицей)
edit (2):
Вот попытка использовать одну поверхность:
# close circle in y-direction
ys <- c(ys, rev(ys), ys[1])
# get corresponding z-values
zs <- rbind(zs, -zs[nrow(zs):1, ], zs[1, ])
# as above, but for color gradient
gradient <-
rbind(gradient, gradient[nrow(gradient):1, ], gradient[1, ])
# plot single surface
plot_ly(x = xs, y = ys, z = zs, surfacecolor = gradient,
type = "surface", colorbar = list(title = 'x'))
Удивительно, но в то время как это должно соединить две половины, ортогональные плоскости x
/y
две создают полную форму, она по-прежнему страдает от того же эффекта "бритвенных зубов", что и выше:
edit (3):
Оказывается, недостающие части возникают из-за того, что z
-values является NaN
когда он близок к 0:
# color points 'outside' the solid purple
gradient[is.nan(zs)] <- -1
# show those previously hidden points
zs[is.nan(zs)] <- 0
# plot exactly as before
plot_ly(x = xs, y = ys, z = zs, surfacecolor = gradient,
type = "surface", colorbar = list(title = 'x'))
Это может быть вызвано численной неустойчивостью подстановки, когда r^2
и y
слишком близки, что приводит к отрицательному вводу для sqrt
где фактический ввод все еще неотрицателен.
Эти швы не связаны с численными проблемами, так как даже при рассмотрении +-4 "близко" к нулю эффект "бритвенных зубов" нельзя полностью исключить:
# re-calculate z-values rounding to zero if 'close'
eps <- 4
zs <- with(coords, ifelse(abs(z2) < eps, 0, sqrt(z2))) %>%
matrix(ncol = length(xs), byrow = TRUE) %>%
rbind(-.[nrow(.):1, ], .[1, ])
# plot exactly as before
plot_ly(x = xs, y = ys, z = zs, surfacecolor = gradient,
type = "surface", colorbar = list(title = 'x'))
Ответы
Ответ 1
Одним из решений было бы перевернуть ваши оси так, чтобы вы вращались вокруг оси z, а не оси x. Я не знаю, возможно ли это, учитывая существующую диаграмму, на которую вы добавляете эту цифру, но она легко решает проблему "зубов".
xs <- seq(-9,9,length.out = 20)
ys <- seq(-9,9,length.out = 20)
coords <-
expand.grid(x = xs, y = ys) %>%
mutate(z2 = (x^2 + y^2)^(1/4))
zs <- matrix(coords$z2, ncol = length(xs), byrow = TRUE)
plot_ly(x = xs, y = ys, z = zs, surfacecolor = zs,
type = "surface", colorbar = list(title = 'x')) %>%
layout(scene = list(zaxis = list(range = c(1,3))))
Ответ 2
интересный вопрос, я изо всех сил пытался использовать поверхностную плотность для улучшения вашего решения. Существует хак, который вы можете сделать с разбиением на несколько строк, что может показаться приятным для этого. Например, только изменения, сделанные в оригинале, включают использование большего количества x точек: от nx до 1000 и изменение add_markers в add_lines. Не может быть масштабируемым, но отлично работает для такого размера данных :)
library(dplyr)
library(plotly)
# radius depends on x
r <- function(x) x^2
# interval of interest
int <- c(1, 3)
# number of points along the x-axis
nx <- 1000
# number of points along the rotation
ntheta <- 36
# set x points and get corresponding radii
coords <- data_frame(x = seq(int[1], int[2], length.out = nx), r = r(x))
# for each x: rotate r to get y and z coordinates
# edit: ensure 0 and pi are both amongst the angles used
coords %<>%
rowwise() %>%
do(data_frame(x = .$x, r = .$r,
theta = seq(0, pi, length.out = ntheta / 2 + 1) %>%
c(pi + .[-c(1, length(.))]))) %>%
ungroup %>%
mutate(y = r * cos(theta), z = r * sin(theta))
# plot points to make sure the coordinates define the desired shape
coords %>%
plot_ly(x = ~x, y = ~y, z = ~z, color = ~x) %>%
add_lines()
Лучший, Джонни
Ответ 3
У меня была еще одна трещина и у меня было более близкое решение, используя "поверхностный" тип. Что помогло посмотреть результаты вашего первого участка поверхности с nx = 5 и ntheta = 18. Причина, по которой это извращение, объясняется тем, как она связывает столбцы в zs (через точки x). Он должен связываться с частичным движением вокруг большего кольца вокруг него, и это заставляет плотность всплывать, чтобы соответствовать этой точке.
Я не могу избавиться от этого неуверенного поведения 100%. Я внес эти изменения:
- добавьте несколько небольших точек в тету по краям: где две плотности объединены. Это уменьшает размер неустойчивой части, так как есть еще несколько точек, близких к границе
- вычисление до mod zs до zs2: убедитесь, что каждое кольцо имеет равную размерность с внешним кольцом, добавив 0 in.
- увеличение nx до 40 и уменьшение ntheta до 18 - больше x делает шаг меньше. уменьшить ntheta для времени выполнения, как я добавил на большее количество очков
шаги приходят в том, как он пытается объединить х-кольца. Теоретически, если у вас больше х колец, это должно устранить эту неровность, но это займет много времени.
Я не думаю, что это отвечает на Q 100%, и я не уверен, что эта библиотека лучше всего подходит для этой работы. Свяжитесь с нами, если у вас есть Q.
library(dplyr)
library(plotly)
# radius depends on x
r <- function(x) x^2
# interval of interest
int <- c(1, 3)
# number of points along the x-axis
nx <- 40
# number of points along the rotation
ntheta <- 18
# set x points and get corresponding radii
coords <- data_frame(x = seq(int[1], int[2], length.out = nx), r = r(x))
# theta: add small increments at the extremities for the density plot
theta <- seq(0, pi, length.out = ntheta / 2 + 1)
theta <- c(theta, pi + theta)
theta <- theta[theta != 2*pi]
inc <- 0.00001
theta <- c(theta, inc, pi + inc, pi - inc, 2*pi - inc)
theta <- sort(theta)
coords %<>%
rowwise() %>%
do(data_frame(x = .$x, r = .$r, theta = theta)) %>%
ungroup %>%
mutate(y = r * cos(theta), z = r * sin(theta))
# get all x & y values used (sort to connect halves on the side)
xs <-
unique(coords$x) %>%
sort
ys <-
unique(coords$y) %>%
sort
# for each possible x/y pair: get z^2 value
coords <-
expand.grid(x = xs, y = ys) %>%
as_data_frame %>%
mutate(r = r(x), z2 = r^2 - y^2)
# format z coordinates above x/y plane as matrix where columns
# represent x and rows y
zs <- matrix(sqrt(coords$z2), ncol = length(xs), byrow = TRUE)
zs2 <- zs
L <- ncol(zs)
for(i in (L-1):1){
w <- which(!is.na(zs[, (i+1)]) & is.na(zs[, i]))
zs2[w, i] <- 0
}
# format x coordiantes as matrix as above (for color gradient)
gradient <-
rep(xs, length(ys)) %>%
matrix(ncol = length(xs), byrow = TRUE)
# plot upper half of shape as surface
p <- plot_ly(x = xs, y = ys, z = zs2, surfacecolor = gradient,
type = "surface", colorbar = list(title = 'x'))
# plot lower have of shape as second surface
p %>%
add_surface(z = -zs2, showscale = FALSE)
Ответ 4
Это не отвечает на ваш вопрос, но даст результат, с которым вы сможете взаимодействовать на веб-странице: не используйте plot_ly
, используйте rgl
. Например,
library(rgl)
# Your initial values...
r <- function(x) x^2
int <- c(1, 3)
nx <- 20
ntheta <- 36
# Set up x and colours for each x
x <- seq(int[1], int[2], length.out = nx)
cols <- colorRampPalette(c("blue", "yellow"), space = "Lab")(nx)
clear3d()
shade3d(turn3d(x, r(x), n = ntheta, smooth = TRUE,
material = list(color = rep(cols, each = 4*ntheta))))
aspect3d(1,1,1)
decorate3d()
rglwidget()
Вы можете сделать лучше на цветах с помощью некоторых упражнений: вы, вероятно, хотите создать функцию, которая использует x
или r(x)
чтобы установить цвет, а не просто повторять цвета так, как я сделал.
Вот результат: