Наложение нормальной кривой на гистограмму в R
Мне удалось найти онлайн, как наложить нормальную кривую на гистограмму в R, но я хотел бы сохранить нормальную "частоту" оси y гистограммы. См. Два сегмента кода ниже и обратите внимание, как во втором, ось y заменяется на "плотность". Как я могу сохранить эту ось y как "частоту", как это показано на первом графике.
КАК БОНУС: Я бы хотел отметить области SD (до 3 SD) на кривой плотности. Как я могу это сделать? Я пробовал abline
, но строка простирается до вершины графика и выглядит уродливой.
g = d$mydata
hist(g)
![enter image description here]()
g = d$mydata
m<-mean(g)
std<-sqrt(var(g))
hist(g, density=20, breaks=20, prob=TRUE,
xlab="x-variable", ylim=c(0, 2),
main="normal curve over histogram")
curve(dnorm(x, mean=m, sd=std),
col="darkblue", lwd=2, add=TRUE, yaxt="n")
![enter image description here]()
Посмотрите, как на изображении выше, ось y - это "плотность". Я бы хотел, чтобы это была "частота".
Ответы
Ответ 1
Вот хороший простой способ:
h <- hist(g, breaks = 10, density = 10,
col = "lightgray", xlab = "Accuracy", main = "Overall")
xfit <- seq(min(g), max(g), length = 40)
yfit <- dnorm(xfit, mean = mean(g), sd = sd(g))
yfit <- yfit * diff(h$mids[1:2]) * length(g)
lines(xfit, yfit, col = "black", lwd = 2)
Ответ 2
Вам просто нужно найти правильный множитель, который можно легко вычислить из объекта hist
.
myhist <- hist(mtcars$mpg)
multiplier <- myhist$counts / myhist$density
mydensity <- density(mtcars$mpg)
mydensity$y <- mydensity$y * multiplier[1]
plot(myhist)
lines(mydensity)
![enter image description here]()
Более полная версия с нормальной плотностью и строками при каждом стандартном отклонении от среднего (включая среднее):
myhist <- hist(mtcars$mpg)
multiplier <- myhist$counts / myhist$density
mydensity <- density(mtcars$mpg)
mydensity$y <- mydensity$y * multiplier[1]
plot(myhist)
lines(mydensity)
myx <- seq(min(mtcars$mpg), max(mtcars$mpg), length.out= 100)
mymean <- mean(mtcars$mpg)
mysd <- sd(mtcars$mpg)
normal <- dnorm(x = myx, mean = mymean, sd = mysd)
lines(myx, normal * multiplier[1], col = "blue", lwd = 2)
sd_x <- seq(mymean - 3 * mysd, mymean + 3 * mysd, by = mysd)
sd_y <- dnorm(x = sd_x, mean = mymean, sd = mysd) * multiplier[1]
segments(x0 = sd_x, y0= 0, x1 = sd_x, y1 = sd_y, col = "firebrick4", lwd = 2)