Ответ 1
Конечно.
Объекты сертификата могут быть созданы экземпляром CertificateFactory - в частности, настроен для создания сертификатов X509. Это можно создать следующим образом:
CertificateFactory certFactory = CertificateFactory.getInstance("X.509");
Затем вам нужно передать ему InputStream, содержащий байты сертификата. Это может быть достигнуто путем упаковки вашего байтового массива в ByteArrayInputStream:
InputStream in = new ByteArrayInputStream(bytes);
X509Certificate cert = (X509Certificate)certFactory.generateCertificate(in);