Отображение текста под графиком, созданным ggplot2

Я пытаюсь отобразить некоторую информацию о данных ниже графика, созданного в ggplot2. Я хотел бы построить переменную N, используя координату оси X графика, но координата Y должна быть 10% от нижней части экрана. Фактически, желаемые координаты Y уже находятся в кадре данных как переменная y_pos.

Я могу думать о 3 подходах, используя ggplot2:

1) Создайте пустой сюжет ниже фактического графика, используйте тот же масштаб, а затем используйте geom_text для построения данных по пустому графику. Этот подход работает, но чрезвычайно сложный.

2) Используйте geom_text для построения данных, но как-то используйте координату y в процентах от экрана (10%). Это заставит цифры отображаться ниже графика. Я не могу понять правильный синтаксис.

3) Используйте grid.text для отображения текста. Я могу легко установить его на 10% от нижней части экрана, но я не могу понять, как настроить координацию X в соответствии с графиком. Я попытался использовать grconvert, чтобы захватить начальную позицию X, но не смог заставить это работать.

Ниже приведен базовый график с фиктивными данными:

graphics.off()      # close graphics windows   

library(car)
library(ggplot2)  #load ggplot
library(gridExtra) #load Grid
library(RGraphics) # support of the "R graphics" book, on CRAN

#create dummy data
test= data.frame(
  Group = c("A", "B", "A","B", "A", "B"), 
  x = c(1 ,1,2,2,3,3 ),
  y = c(33,25,27,36,43,25),
  n=c(71,55,65,58,65,58),
  y_pos=c(9,6,9,6,9,6)
  )

#create ggplot
p1 <- qplot(x, y, data=test, colour=Group) +
  ylab("Mean change from baseline") + 
  geom_line()+
  scale_x_continuous("Weeks", breaks=seq(-1,3, by = 1) ) +
  opts( 
        legend.position=c(.1,0.9))

#display plot
p1

Модифицированный gplot внизу отображает числа предметов, однако они отображаются в разделе "Сюжет". Они заставляют масштаб Y масштабироваться. Я бы хотел показать эти цифры НИЖЕ сюжета.

    p1 <- qplot(x, y, data=test, colour=Group) +
  ylab("Mean change from baseline") + 
  geom_line()+
  scale_x_continuous("Weeks", breaks=seq(-1,3, by = 1) ) +
  opts( plot.margin = unit(c(0,2,2,1), "lines"),
        legend.position=c(.1,0.9))+
  geom_text(data = test,aes(x=x,y=y_pos,label=n))

p1

Другой подход отображения чисел включает в себя создание фиктивного участка ниже фактического графика. Вот код:

graphics.off()      # close graphics windows   

library(car)
library(ggplot2)  #load ggplot
library(gridExtra) #load Grid
library(RGraphics) # support of the "R graphics" book, on CRAN

#create dummy data
test= data.frame(
  group = c("A", "B", "A","B", "A", "B"), 
  x = c(1 ,1,2,2,3,3 ),
  y = c(33,25,27,36,43,25),
  n=c(71,55,65,58,65,58),
  y_pos=c(15,6,15,6,15,6)
  )


p1 <- qplot(x, y, data=test, colour=group) +
  ylab("Mean change from baseline") + 
  opts(plot.margin = unit(c(1,2,-1,1), "lines")) +
  geom_line()+
  scale_x_continuous("Weeks", breaks=seq(-1,3, by = 1) ) +
  opts(legend.position="bottom",
       legend.title=theme_blank(),
       title.text="Line plot using GGPLOT") 
p1

p2 <- qplot(x, y, data=test, geom="blank")+
  ylab(" ")+
  opts(     plot.margin = unit(c(0,2,-2,1), "lines"),
            axis.line = theme_blank(), 
            axis.ticks = theme_segment(colour = "white"),           
            axis.text.x=theme_text(angle=-90,colour="white"),
            axis.text.y=theme_text(angle=-90,colour="white"),
            panel.background = theme_rect(fill = "transparent",colour = NA), 
            panel.grid.minor = theme_blank(),      
            panel.grid.major = theme_blank()
            )+
  geom_text(data = test,aes(x=x,y=y_pos,label=n)) 
p2

grid.arrange(p1, p2, heights = c(8.5, 1.5),             nrow=2 )
enter code here

Однако это очень сложно и будет трудно модифицировать для разных данных. В идеале я хотел бы передать координаты Y в процентах от экрана. Спасибо заранее!

Ответы

Ответ 1

Отредактировано opts устарело, заменено на theme; element_blank заменил theme_blank; и ggtitle() используется вместо opts(title = ...

Сэнди - большое вам спасибо!!!! Это делает именно то, что я хочу. Я бы хотел, чтобы мы могли контролировать обрезку в geom.text или geom.annotate.

Я собрал следующую программу, если кому-то еще интересно.

 rm(list = ls())     # clear objects  
 graphics.off()      # close graphics windows   

library(ggplot2)
library(gridExtra)

#create dummy data
test= data.frame(
  group = c("Group 1", "Group 1", "Group 1","Group 2", "Group 2", "Group 2"), 
  x = c(1 ,2,3,1,2,3 ),
  y = c(33,25,27,36,23,25),
  n=c(71,55,65,58,65,58),
  ypos=c(18,18,18,17,17,17)

  )


p1 <- qplot(x=x, y=y, data=test, colour=group) +
  ylab("Mean change from baseline") + 
  theme(plot.margin = unit(c(1,3,8,1), "lines")) +
  geom_line()+
  scale_x_continuous("Visits", breaks=seq(-1,3) ) +
  theme(legend.position="bottom",
       legend.title=element_blank())+
   ggtitle("Line plot") 


# Create the textGrobs 
for (ii in 1:nrow(test))
{
  #display numbers at each visit
  p1=p1+ annotation_custom(grob = textGrob(test$n[ii]),  
                           xmin = test$x[ii], 
                           xmax = test$x[ii], 
                           ymin = test$ypos[ii], 
                           ymax = test$ypos[ii])

    #display group text
    if (ii %in% c(1,4)) #there is probably a better way 
      {
    p1=p1+ annotation_custom(grob = textGrob(test$group[ii]),  
                             xmin = 0.85, 
                             xmax = 0.85, 
                             ymin = test$ypos[ii], 
                             ymax = test$ypos[ii])
    }

  }




  # Code to override clipping
  gt <- ggplot_gtable(ggplot_build(p1))
  gt$layout$clip[gt$layout$name=="panel"] <- "off"
  grid.draw(gt)

Ответ 2

Обновлено opts() заменено на theme()

В приведенном ниже коде строится базовый график с более широким полем в нижней части графика. TextGrob создается, затем вставляется в график с помощью annotation_custom(). За исключением того, что текст не отображается, потому что он находится за пределами панели сюжета - вывод подрезается к панели. Но используя baptiste code здесь, обрезание может быть отменено. Позиция относится к единицам данных, и обе текстовые метки центрированы.

library(ggplot2)
library(grid)

# Base plot
df = data.frame(x=seq(1:10), y = seq(1:10))
p = ggplot(data = df, aes(x = x, y = y)) + geom_point() + ylim(0,10) +
    theme(plot.margin = unit(c(1,1,3,1), "cm"))
p

# Create the textGrobs
Text1 = textGrob(paste("Largest x-value is", round(max(df$x), 2), sep = " "))
Text2 = textGrob(paste("Mean = ", mean(df$x), sep = ""))

p1 = p + annotation_custom(grob = Text1,  xmin = 4, xmax = 4, ymin = -3, ymax = -3) +
        annotation_custom(grob = Text2,  xmin = 8, xmax = 8, ymin = -3, ymax = -3)
p1

# Code to override clipping
gt <- ggplotGrob(p1)
gt$layout$clip[gt$layout$name=="panel"] <- "off"
grid.draw(gt)

Или, используя grid функции для создания и размещения метки.

p
grid.text((paste("Largest x-value is", max(df$x), sep = " ")),
   x = unit(.2, "npc"), y = unit(.1, "npc"), just = c("left", "bottom"), 
   gp = gpar(fontface = "bold", fontsize = 18, col = "blue"))

Edit Или добавьте текст grob, используя функции gtable.

library(ggplot2)
library(grid)
library(gtable)

# Base plot
df = data.frame(x=seq(1:10), y = seq(1:10))
p = ggplot(data = df, aes(x = x, y = y)) + geom_point() + ylim(0,10) 

# Construct the text grob
lab = textGrob((paste("Largest x-value is", max(df$x), sep = " ")),
   x = unit(.1, "npc"), just = c("left"), 
   gp = gpar(fontface = "bold", fontsize = 18, col = "blue"))


gp = ggplotGrob(p)

# Add a row below the 2nd from the bottom
gp = gtable_add_rows(gp, unit(2, "grobheight", lab), -2)

# Add 'lab' grob to that row, under the plot panel
gp = gtable_add_grob(gp, lab, t = -2, l = gp$layout[gp$layout$name == "panel",]$l)

grid.newpage()
grid.draw(gp)

Ответ 3

Текущая версия ( > 2.1) имеет + labs(caption = "text"), которая отображает аннотацию ниже графика. Это тема (свойства шрифта,... выравнивание влево/вправо). Для примера см. https://github.com/hadley/ggplot2/pull/1582.

Ответ 4

На самом деле лучшим ответом и самым простым решением является использование пакета cowplot.

Версия 0.5.0 пакета cowplot (на CRAN) обрабатывает субтитры ggplot2 с помощью функции add_sub.

Используйте его так:

  diamondsCubed <-ggplot(aes(carat, price), data = diamonds) + 
  geom_point() + 
  scale_x_continuous(trans = cuberoot_trans(), limits = c(0.2, 3),
                     breaks = c(0.2, 0.5, 1, 2, 3)) + 
  scale_y_continuous(trans = log10_trans(), limits = c(350, 15000),
                     breaks = c(350, 1000, 5000, 10000, 15000)) +
  ggtitle('Price log10 by Cube-Root of Carat') +
  theme_xkcd()


  ggdraw(add_sub(diamondsCubed, "This is an annotation.\nAnnotations can span multiple lines."))