Pyspark: проанализировать столбец строк json
У меня есть фреймворк pyspark, состоящий из одного столбца, называемого json
, где каждая строка является строкой unicode json. Я хотел бы проанализировать каждую строку и вернуть новую фреймворк данных, где каждая строка является разобранным json.
# Sample Data Frame
jstr1 = u'{"header":{"id":12345,"foo":"bar"},"body":{"id":111000,"name":"foobar","sub_json":{"id":54321,"sub_sub_json":{"col1":20,"col2":"somethong"}}}}'
jstr2 = u'{"header":{"id":12346,"foo":"baz"},"body":{"id":111002,"name":"barfoo","sub_json":{"id":23456,"sub_sub_json":{"col1":30,"col2":"something else"}}}}'
jstr3 = u'{"header":{"id":43256,"foo":"foobaz"},"body":{"id":20192,"name":"bazbar","sub_json":{"id":39283,"sub_sub_json":{"col1":50,"col2":"another thing"}}}}'
df = sql_context.createDataFrame([Row(json=jstr1),Row(json=jstr2),Row(json=jstr3)])
Я попытался сопоставить каждую строку с json.loads
:
(df
.select('json')
.rdd
.map(lambda x: json.loads(x))
.toDF()
).show()
Но это возвращает a TypeError: expected string or buffer
Я подозреваю, что часть проблемы заключается в том, что при преобразовании из dataframe
в rdd
информация о схеме теряется, поэтому я также попытался вручную ввести информацию о схеме:
schema = StructType([StructField('json', StringType(), True)])
rdd = (df
.select('json')
.rdd
.map(lambda x: json.loads(x))
)
new_df = sql_context.createDataFrame(rdd, schema)
new_df.show()
Но я получаю тот же TypeError
.
Рассматривая этот ответ, похоже, что выравнивание строк с flatMap
может быть полезно здесь, но я не уверен в этом:
schema = StructType([StructField('json', StringType(), True)])
rdd = (df
.select('json')
.rdd
.flatMap(lambda x: x)
.flatMap(lambda x: json.loads(x))
.map(lambda x: x.get('body'))
)
new_df = sql_context.createDataFrame(rdd, schema)
new_df.show()
Я получаю эту ошибку: AttributeError: 'unicode' object has no attribute 'get'
.
Ответы
Ответ 1
Преобразование DataFrame с json-строками в структурированный dataframe is'a на самом деле довольно прост в искровом случае, если раньше вы конвертировали dataframe в RDD строк (см. http://spark.apache.org/docs/latest/sql-programming-guide.html#json-datasets)
Например:
>>> new_df = sql_context.read.json(df.rdd.map(lambda r: r.json))
>>> new_df.printSchema()
root
|-- body: struct (nullable = true)
| |-- id: long (nullable = true)
| |-- name: string (nullable = true)
| |-- sub_json: struct (nullable = true)
| | |-- id: long (nullable = true)
| | |-- sub_sub_json: struct (nullable = true)
| | | |-- col1: long (nullable = true)
| | | |-- col2: string (nullable = true)
|-- header: struct (nullable = true)
| |-- foo: string (nullable = true)
| |-- id: long (nullable = true)
Ответ 2
Для Spark 2. 1+ вы можете использовать from_json
который позволяет сохранять другие столбцы не-json в кадре данных следующим образом:
from pyspark.sql.functions import from_json, col
json_schema = spark.read.json(df.rdd.map(lambda row: row.json)).schema
df.withColumn('json', from_json(col('json'), json_schema))
Вы позволяете Spark получить схему строкового столбца json. Тогда столбец df.json
больше не является StringType, а правильно декодированная структура json, то есть вложенный StrucType
и все остальные столбцы df
, сохраняются как есть.
Вы можете получить доступ к содержимому json следующим образом:
df.select(col('json.header').alias('header'))
Ответ 3
Существующие ответы не работают, если ваш JSON отличается от идеального/традиционного формата. Например, вывод схемы на основе RDD ожидает JSON в фигурных скобках {}
и предоставит неверную схему (в результате чего будут null
значения), если, например, ваши данные выглядят следующим образом:
[
{
"a": 1.0,
"b": 1
},
{
"a": 0.0,
"b": 2
}
]
Я написал функцию, чтобы обойти эту проблему, очистив JSON так, чтобы он находился в другом объекте JSON:
def parseJSONCols(df, *cols, sanitize=True):
"""Auto infer the schema of a json column and parse into a struct.
rdd-based schema inference works if you have well-formatted JSON,
like ''{"key": "value", ...}'', but breaks if your 'JSON' is just a
string (''"data"'') or is an array (''[1, 2, 3]''). In those cases you
can fix everything by wrapping the data in another JSON object
(''{"key": [1, 2, 3]}''). The ''sanitize'' option (default True)
automatically performs the wrapping and unwrapping.
The schema inference is based on this
'SO Post <https://stackoverflow.com/a/45880574)/>'_.
Parameters
----------
df : pyspark dataframe
Dataframe containing the JSON cols.
*cols : string(s)
Names of the columns containing JSON.
sanitize : boolean
Flag indicating whether you'd like to sanitize your records
by wrapping and unwrapping them in another JSON object layer.
Returns
-------
pyspark dataframe
A dataframe with the decoded columns.
"""
res = df
for i in cols:
# sanitize if requested.
if sanitize:
res = (
res.withColumn(
i,
psf.concat(psf.lit('{"data": '), i, psf.lit('}'))
)
)
# infer schema and apply it
schema = spark.read.json(res.rdd.map(lambda x: x[i])).schema
res = res.withColumn(i, psf.from_json(psf.col(i), schema))
# unpack the wrapped object if needed
if sanitize:
res = res.withColumn(i, psf.col(i).data)
return res
Примечание: psf
= pyspark.sql.functions
.
Ответ 4
Здесь краткая (искристая SQL) версия функции @nolan-conaway parseJSONCols
.
SELECT
explode(
from_json(
concat('{"data":',
'[{"a": 1.0,"b": 1},{"a": 0.0,"b": 2}]',
'}'),
'data array<struct<a:DOUBLE, b:INT>>'
).data) as data;
PS. Я также добавил функцию разнесения: P
Вам нужно знать некоторые типы HIVE SQL