С Android 4.4 KitKat Google обновляет ядро Linux до версии 3.8, которая является необходимой версией ядра для Docker.
Я не знаю часть AUFS, но будет ли способ запуска контейнеров докеров на андроид с этим обновлением?
Согласно документации, в ядре Android отсутствует немало функции ядра, необходимые для LXC.
Возможно, в будущем с Docker 1.x возможно создать плагин с функциями Android вместо LXC. Но на данный момент вам нужно будет создать пользовательское ядро Android, а затем создать для него LXC.
Есть некоторые люди, которые действительно работают над этим, и Стефан Грабер имеет хорошее резюме трудностей в своем блоге.
Это зависит от того, скомпилировано это ядро с необходимыми функциями для запуска контейнеров. Если это так, то Docker можно использовать на Android (особенно Docker 0.7, который сейчас находится в статусе кандидата в релизе и больше не требует AUFS).